1.- Incrementar el estado de salud de la población y su satisfacción con los servicios. (Lineamientos: 24, 98, 99, 108, 109, 116, 119, 126-132, 255, 269-272)
2.- Fortalecer las acciones de Higiene, Epidemiología y Microbiología. (Lineamientos: 126-128, 182)
3.- Ejercer la Regulación Sanitaria. (Lineamientos: 72, 83, 126-129, 131, 132, 180-182, 185)
4.- Consolidar las estrategias de formación, capacitación e investigación. (Lineamientos: 98, 116, 126, 127, 130, 255, 270)
5.- Cumplir con las diferentes modalidades de exportación de servicios y de la cooperación internacional del sistema de salud cubano. (Lineamientos: 63, 64, 67, 68, 69, 70, 72, 83, 84, 85, 86, 126, 129, 130, 133)
6.- Incrementar la racionalidad y la eficiencia económica en el sector. (Lineamientos: 1-7, 14, 21, 23, 24, 26, 42, 53, 67-70, 72, 73, 74, 82, 84, 85, 88, 89, 90, 92, 101, 116, 118, 126-133, 204-207, 238, 244, 252, 255, 257, 258, 261, 271)